Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb6Q9Z0T9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb6Q9Z0T9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms