Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ5

Apip, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApipQ9WVQ5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApipQ9WVQ5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ApipQ9WVQ5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApipQ9WVQ5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms