Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms