Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcd6ipQ9WU78 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcd6ipQ9WU78 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms