Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Wdr54Q9R0D8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr54Q9R0D8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms