Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod2Q9R0B9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Plod2Q9R0B9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Plod2Q9R0B9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod2Q9R0B9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod2Q9R0B9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod2Q9R0B9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod2Q9R0B9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod2Q9R0B9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod2Q9R0B9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms