Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Col4a4Q9QZR9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Col4a4Q9QZR9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Col4a4Q9QZR9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Col4a4Q9QZR9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Col4a4Q9QZR9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a4Q9QZR9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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