Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpc1Q9QZF2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpc1Q9QZF2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms