Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndrg3Q9QYF9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndrg3Q9QYF9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndrg3Q9QYF9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndrg3Q9QYF9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndrg3Q9QYF9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndrg3Q9QYF9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndrg3Q9QYF9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndrg3Q9QYF9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndrg3Q9QYF9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndrg3Q9QYF9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndrg3Q9QYF9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndrg3Q9QYF9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndrg3Q9QYF9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndrg3Q9QYF9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndrg3Q9QYF9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndrg3Q9QYF9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndrg3Q9QYF9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndrg3Q9QYF9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms