Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx8Q9QXV1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx8Q9QXV1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms