Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA6

Slc7a9, b(0,+)-type amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a9Q9QXA6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc7a9Q9QXA6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a9Q9QXA6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc7a9Q9QXA6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms