Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB8

Cntn6, Contactin-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn6Q9JMB8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn6Q9JMB8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn6Q9JMB8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms