Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms