Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIY8

Cml3, Probable N-acetyltransferase CML3, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml3Q9JIY8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml3Q9JIY8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml3Q9JIY8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cml3Q9JIY8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cml3Q9JIY8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cml3Q9JIY8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cml3Q9JIY8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cml3Q9JIY8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms