Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmod3Q9JHJ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmod3Q9JHJ0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmod3Q9JHJ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod3Q9JHJ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod3Q9JHJ0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod3Q9JHJ0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod3Q9JHJ0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod3Q9JHJ0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod3Q9JHJ0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod3Q9JHJ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod3Q9JHJ0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod3Q9JHJ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod3Q9JHJ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod3Q9JHJ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmod3Q9JHJ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmod3Q9JHJ0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmod3Q9JHJ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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