Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Timp4Q9JHB3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timp4Q9JHB3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms