Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn19Q9ET38 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn19Q9ET38 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Cldn19Q9ET38 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn19Q9ET38 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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