Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms