Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms