Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfcp2Q9ERA0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tfcp2Q9ERA0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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