Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rnf6Q9DBU5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf6Q9DBU5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms