Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc91Q9D8L5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc91Q9D8L5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc91Q9D8L5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms