Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fip1l1Q9D824 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms