Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rab11fip1Q9D620 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip1Q9D620 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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