Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad1Q9D5T0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atad1Q9D5T0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad1Q9D5T0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms