Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Zcchc13Q9D548 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Zcchc13Q9D548 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Zcchc13Q9D548 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Zcchc13Q9D548 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Zcchc13Q9D548 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Zcchc13Q9D548 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zcchc13Q9D548 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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