Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc105Q9D4K7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc105Q9D4K7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms