Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Utp11Q9CZJ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Utp11Q9CZJ1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms