Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nde1Q9CZA6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms