Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdhd3Q9CYW4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdhd3Q9CYW4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms