Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChtopQ9CY57 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms