Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smc1aQ9CU62 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smc1aQ9CU62 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc1aQ9CU62 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms