Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sft2d3Q9CSV6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms