Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim11Q99PQ2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim11Q99PQ2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim11Q99PQ2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms