Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdh23Q99PF4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh23Q99PF4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh23Q99PF4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh23Q99PF4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms