Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rassf3Q99P51 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rassf3Q99P51 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rassf3Q99P51 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rassf3Q99P51 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rassf3Q99P51 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rassf3Q99P51 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rassf3Q99P51 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rassf3Q99P51 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rassf3Q99P51 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rassf3Q99P51 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rassf3Q99P51 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rassf3Q99P51 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rassf3Q99P51 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rassf3Q99P51 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms