Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpgs1Q99MS8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpgs1Q99MS8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms