Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm2d1Q99MB3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tm2d1Q99MB3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms