Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gins4Q99LZ3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gins4Q99LZ3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms