Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cmtm3Q99LJ5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms