Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf34Q99KR6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf34Q99KR6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms