Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Reep3Q99KK1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Reep3Q99KK1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms