Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf144aQ925F3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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