Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf3Q922U1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf3Q922U1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf3Q922U1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms