Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Supt16hQ920B9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Supt16hQ920B9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt16hQ920B9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
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