Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp9Q91WM3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp9Q91WM3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp9Q91WM3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms