Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx15Q91WE1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx15Q91WE1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snx15Q91WE1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx15Q91WE1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx15Q91WE1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx15Q91WE1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx15Q91WE1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx15Q91WE1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx15Q91WE1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx15Q91WE1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx15Q91WE1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx15Q91WE1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx15Q91WE1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms