Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI7

Ccdc65, Coiled-coil domain-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc65Q8VHI7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc65Q8VHI7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc65Q8VHI7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms