Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEF1

Gramd1a, GRAM domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd1aQ8VEF1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gramd1aQ8VEF1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gramd1aQ8VEF1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gramd1aQ8VEF1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gramd1aQ8VEF1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gramd1aQ8VEF1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gramd1aQ8VEF1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gramd1aQ8VEF1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gramd1aQ8VEF1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gramd1aQ8VEF1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gramd1aQ8VEF1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gramd1aQ8VEF1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gramd1aQ8VEF1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gramd1aQ8VEF1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gramd1aQ8VEF1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms