Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep57l1Q8VDS7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep57l1Q8VDS7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep57l1Q8VDS7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms